分居时间长短并非离婚净身出户的决定因素。离婚案件审理时间依据《民事诉讼法》，简易程序3个月内审结，普通程序6个月内审结。净身出户涉及财产分割，需根据具体情况判断，严重情况如不及时处理，可能导致财产权益受损。
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分居后起诉离婚净身出户的处理方式包括协议离婚和诉讼离婚。若双方就财产分割达成一致，可选择协议离婚；若无法协商，则需通过法院诉讼解决。选择何种方式应基于双方协商情况、财产复杂性及律师建议。